Sistem za obradu, skladištenje i pretraživanje jednoćelijskih RNK sekvenciranih podataka (eng. Single Cell RNASeq)

Abstrakt

Rad predstavlja razvoj integrisane platforme za upravljanje jednoćelijskim RNK sekvencijskim podacima. Platforma kombinuje automatizovane Nextflow radne tokove, relacionu bazu podataka za metapodatke i RAG arhitekturu za kontekstualno pretraživanje. Implementiran Python API i veb interfejs omogućavaju efikasno dodavanje studija i praćenje obrada. Evaluacija potvrđuje značajno poboljšanje dostupnosti jednoćelijskih genomskih podataka.

Ključne reči: automatizacija bioinformatike, genomska bioinformatika, jednoćelijska sekvencija RNK, Nextflow, Python API, RAG sistem pretrage, scRNA-seq, upravljanje genomskim podacima, veštačka inteligencija u biologiji

Objavljen na sajtu: 1.7.2025

Priloženi fajl: kcesarevic.pdf