Ksenija Ćesarević
- Abstrakt:
Rad predstavlja razvoj integrisane platforme za upravljanje jednoćelijskim RNK sekvencijskim podacima. Platforma kombinuje automatizovane Nextflow radne tokove, relacionu bazu podataka za metapodatke i RAG arhitekturu za kontekstualno pretraživanje. Implementiran Python API i veb interfejs omogućavaju efikasno dodavanje studija i praćenje obrada. Evaluacija potvrđuje značajno poboljšanje dostupnosti jednoćelijskih genomskih podataka.
- Ključne reči: automatizacija bioinformatike, genomska bioinformatika, jednoćelijska sekvencija RNK, Nextflow, Python API, RAG sistem pretrage, scRNA-seq, upravljanje genomskim podacima, veštačka inteligencija u biologiji
- Objavljen na sajtu: 2025-07-01
- Priloženi fajl: kcesarevic.pdf