Систем за обраду, складиштење и претраживање једноћелијских РНК секвенцираних података (енг. Single Cell RNASeq)

Абстракт

Рад представља развој интегрисане платформе за управљање једноћелијским РНК секвенцијским подацима. Платформа комбинује аутоматизоване Nextflow радне токове, релациону базу података за метаподатке и RAG архитектуру за контекстуално претраживање. Имплементиран Python API и веб интерфејс омогућавају ефикасно додавање студија и праћење обрада. Евалуација потврђује значајно побољшање доступности једноћелијских геномских података.

Кључне речи: Aутоматизација биоинформатике, геномска биоинформатика, једноћелијска секвенција РНК, Nextflow, Python API, RAG систем претраге, scRNA-seq, управљање геномским подацима, вештачка интелигенција у биологији

Објављен на сајту: 1.7.2025

Тип рада: Научни радови

Приложени фајл: kcesarevic.pdf